Mit dem Zustrom von Flüchtlingen aus dem Nahen Osten nach Deutschland seit dem Jahr 2015 wurde der große Bedarf an praktischer, sozialer und seelsorgerlicher Unterstützung deutlich. Viele von ihnen hatten bereits in ihren Heimatländern, auf der Flucht sowie in den damaligen überfüllten Unterkünften in Deutschland schweres Leid erlebt. Durch praktische Hilfe entstanden enge Beziehungen und Freundschaften. Daraus entwickelten sich viele Gespräche über die deutsche Kultur, die von christlichen Werten und der Bibel geprägt ist, so wie zum Beispiel Hilfsbereitschaft und Freundlichkeit, und dass jeder Mensch eine Würde hat. So entstanden Hauskreise zum gemeinsamen Bibelstudium und zum besseren Verständnis des Einflusses der Bibel auf die Gesellschaft und das persönliche Leben.

Diese Gemeinschaft wuchs besonders durch den Familiennachzug vieler Flüchtlingsfamilien. Deshalb entwickelten sich aus den Hauskreisen regelmäßige Treffen im heutigen Kirchengebäude in Lünen.

Im März 2023 wurde die Alhayat Kirche mit Unterstützung des Bundes Evangelisch-Freikirchlicher Gemeinden BEFG in einem besonderen Gottesdienst offiziell eingeweiht. Seitdem haben sich Familien aus verschiedenen arabischsprachigen Ländern des Nahen Ostens der Gemeinde angeschlossen. Schrittweise entstanden verschiedene Dienste für Kinder, Jugendliche und Frauen.